MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	GGT	2	6	30	35	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019755	ACT	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308219
3	NC_019755	TGC	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308219
4	NC_019755	GCTG	3	12	128	139	0 %	25 %	50 %	25 %	428308219
5	NC_019755	ACT	2	6	201	206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308219
6	NC_019755	AGCC	2	8	337	344	25 %	0 %	25 %	50 %	428308219
7	NC_019755	TAG	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308219
8	NC_019755	AAG	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308219
9	NC_019755	AGA	2	6	518	523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308219
10	NC_019755	CAATCA	2	12	531	542	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428308219
11	NC_019755	ATGT	2	8	681	688	25 %	50 %	25 %	0 %	428308219
12	NC_019755	CCA	2	6	720	725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308219
13	NC_019755	TTA	2	6	783	788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308219
14	NC_019755	TAA	2	6	800	805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308219
15	NC_019755	TTAT	2	8	864	871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019755	TAG	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019755	A	6	6	954	959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019755	TGG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308220
19	NC_019755	A	6	6	1130	1135	100 %	0 %	0 %	0 %	428308220
20	NC_019755	AAT	2	6	1144	1149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308220
21	NC_019755	T	6	6	1163	1168	0 %	100 %	0 %	0 %	428308220
22	NC_019755	ATT	2	6	1173	1178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308220
23	NC_019755	AAT	2	6	1185	1190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308220
24	NC_019755	TCA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308220
25	NC_019755	ATTTG	2	10	1239	1248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019755	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019755	CTGT	2	8	1420	1427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019755	AAG	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019755	ATG	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019755	T	6	6	1525	1530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019755	CTTT	2	8	1552	1559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019755	TAC	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019755	CT	3	6	1716	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019755	GTGCT	2	10	1732	1741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_019755	TTA	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019755	GC	3	6	1843	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019755	TTA	2	6	1901	1906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308221
38	NC_019755	TA	3	6	1905	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	428308221
39	NC_019755	CTC	2	6	2084	2089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308221
40	NC_019755	AGG	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308221
41	NC_019755	CAAAGA	2	12	2190	2201	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428308222
42	NC_019755	TGG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308222
43	NC_019755	TA	3	6	2310	2315	50 %	50 %	0 %	0 %	428308222
44	NC_019755	A	6	6	2332	2337	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
45	NC_019755	AAG	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
46	NC_019755	ATT	2	6	2363	2368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
47	NC_019755	ACT	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
48	NC_019755	TGA	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
49	NC_019755	A	6	6	2497	2502	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
50	NC_019755	T	6	6	2561	2566	0 %	100 %	0 %	0 %	428308222
51	NC_019755	ACA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308222
52	NC_019755	ACT	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
53	NC_019755	TA	3	6	2729	2734	50 %	50 %	0 %	0 %	428308222
54	NC_019755	TTA	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
55	NC_019755	GTG	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308222
56	NC_019755	ACA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308222
57	NC_019755	CAG	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
58	NC_019755	GAA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
59	NC_019755	A	6	6	2996	3001	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
60	NC_019755	A	6	6	3098	3103	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
61	NC_019755	GCT	2	6	3112	3117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308222
62	NC_019755	TAC	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
63	NC_019755	ATT	2	6	3294	3299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
64	NC_019755	ACT	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
65	NC_019755	GAA	2	6	3364	3369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
66	NC_019755	A	6	6	3412	3417	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
67	NC_019755	CAG	2	6	3463	3468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
68	NC_019755	AAG	2	6	3476	3481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
69	NC_019755	AAT	2	6	3544	3549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308222
70	NC_019755	CAAT	2	8	3564	3571	50 %	25 %	0 %	25 %	428308222
71	NC_019755	GAT	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
72	NC_019755	AGA	2	6	3588	3593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
73	NC_019755	ACT	2	6	3628	3633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
74	NC_019755	GAT	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
75	NC_019755	CAT	2	6	3846	3851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
76	NC_019755	CAAC	2	8	3862	3869	50 %	0 %	0 %	50 %	428308222
77	NC_019755	TTA	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
78	NC_019755	GAC	2	6	4021	4026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
79	NC_019755	ATT	2	6	4068	4073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
80	NC_019755	TGA	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
81	NC_019755	AAAT	2	8	4119	4126	75 %	25 %	0 %	0 %	428308222
82	NC_019755	A	6	6	4255	4260	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
83	NC_019755	CCA	2	6	4317	4322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308222
84	NC_019755	AGTT	2	8	4460	4467	25 %	50 %	25 %	0 %	428308222
85	NC_019755	GAC	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
86	NC_019755	GAC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308222
87	NC_019755	ATC	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
88	NC_019755	ATA	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308222
89	NC_019755	TTA	2	6	4597	4602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308222
90	NC_019755	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
91	NC_019755	CTA	2	6	4802	4807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308222
92	NC_019755	TGA	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
93	NC_019755	CA	3	6	4968	4973	50 %	0 %	0 %	50 %	428308222
94	NC_019755	GTA	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
95	NC_019755	AGT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308222
96	NC_019755	A	6	6	5023	5028	100 %	0 %	0 %	0 %	428308222
97	NC_019755	AAG	2	6	5044	5049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308222
98	NC_019755	TC	3	6	5198	5203	0 %	50 %	0 %	50 %	428308223
99	NC_019755	AGC	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308223
100	NC_019755	AGCA	2	8	5321	5328	50 %	0 %	25 %	25 %	428308223
101	NC_019755	GTCAAA	2	12	5357	5368	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308223
102	NC_019755	CTGA	2	8	5377	5384	25 %	25 %	25 %	25 %	428308223
103	NC_019755	GA	3	6	5390	5395	50 %	0 %	50 %	0 %	428308223
104	NC_019755	TGT	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308223
105	NC_019755	ATCAA	2	10	5478	5487	60 %	20 %	0 %	20 %	428308223
106	NC_019755	TGCCT	2	10	5490	5499	0 %	40 %	20 %	40 %	428308223
107	NC_019755	CT	3	6	5521	5526	0 %	50 %	0 %	50 %	428308223
108	NC_019755	GGTC	2	8	5529	5536	0 %	25 %	50 %	25 %	428308223
109	NC_019755	AT	4	8	5551	5558	50 %	50 %	0 %	0 %	428308223
110	NC_019755	CTTG	2	8	5635	5642	0 %	50 %	25 %	25 %	428308223
111	NC_019755	TGC	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308223
112	NC_019755	ATAG	2	8	5660	5667	50 %	25 %	25 %	0 %	428308223
113	NC_019755	CTA	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308223
114	NC_019755	AAT	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308223
115	NC_019755	CAA	2	6	5822	5827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308223
116	NC_019755	TGT	2	6	5851	5856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308223
117	NC_019755	TAA	2	6	5884	5889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308223
118	NC_019755	TTA	2	6	5954	5959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019755	ATG	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019755	A	6	6	6007	6012	100 %	0 %	0 %	0 %	428308224
121	NC_019755	AGC	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308224
122	NC_019755	TGG	2	6	6075	6080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308224
123	NC_019755	TGC	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308224
124	NC_019755	CTTT	2	8	6119	6126	0 %	75 %	0 %	25 %	428308224
125	NC_019755	CTA	2	6	6170	6175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308224
126	NC_019755	TAAG	2	8	6200	6207	50 %	25 %	25 %	0 %	428308224
127	NC_019755	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
128	NC_019755	AGA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308224
129	NC_019755	AGT	2	6	6336	6341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
130	NC_019755	GTA	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
131	NC_019755	CTAGAA	2	12	6508	6519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308224
132	NC_019755	CAC	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308224
133	NC_019755	AGAA	2	8	6591	6598	75 %	0 %	25 %	0 %	428308224
134	NC_019755	AGC	3	9	6606	6614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308224
135	NC_019755	TAG	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308224
136	NC_019755	ACG	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308224
137	NC_019755	CAA	2	6	6709	6714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308224
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264	NC_019755	AGT	2	6	12605	12610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_019755	CACTT	2	10	12794	12803	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
266	NC_019755	ACT	2	6	12887	12892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_019755	ATC	2	6	12951	12956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_019755	CTC	2	6	12958	12963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_019755	ACC	2	6	12965	12970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_019755	GTA	2	6	13041	13046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019755	TAA	2	6	13093	13098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019755	ACG	2	6	13139	13144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_019755	TAA	2	6	13238	13243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019755	TC	3	6	13273	13278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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276	NC_019755	GATT	2	8	13396	13403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_019755	AAG	2	6	20213	20218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308233
410	NC_019755	CAT	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308233
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423	NC_019755	AT	3	6	21145	21150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_019755	A	7	7	22248	22254	100 %	0 %	0 %	0 %	428308235
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499	NC_019755	AAG	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_019755	AAATT	2	10	24569	24578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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